Описание проекта
1- Разобраться каким способом связываются эти файлы
2- Модернизировать. Исправить недочеты.
3- Исправить увеличение размера файла. Убрать создаваемые копии в файле.
4- Автоматизировать процесс выполнения скрипта.
Так как размеры файлов большие предоставлю через размещение на файловом сервере.